Con sus conmutadores de libre asignación y su amplio soporte de control en tiempo real, el MD-500 ofrece una flexibilidad de expresión e interpretación sin igual. Por defecto, los conmutadores A, B y TAP/CTL ofrecen control para la selección de patch/banco y bypass, además de tap tempo o ajuste en tiempo real de uno o más parámetros. Si lo desea, los conmutadores pueden personalizarse para acceder a tres patches mod diferentes, al modo A/B Simul y a otras funciones. A través de la toma CTL 1,2/EXP del panel trasero, puede conectar hasta dos conmutadores de pedal para un mayor control, o un pedal de expresión para ajustar el wah, la velocidad del efecto y otros parámetros. También se incluye E/S MIDI, lo que permite más posibilidades creativas con configuraciones avanzadas.