ME-90 coloca uma enorme biblioteca de efeitos BOSS sob seu comando, oferecendo sete categorias diferentes preenchidas com seleções derivadas da topo-de-gama GT-1000. Tudo o que precisas está aqui, desde overdrives e distorções até efeitos de pitch/mod, delays e reverbs de alta qualidade. Também obténs 11 Pedal FX dedicados, um looper e efeitos especializados, como simulação acústica e afinação. Existem 60 tipos de efeitos no total, com acesso a mais de 20 através do BOSS Tone Studio. Um loop de send/return está disponível para pedais externos, completo com a capacidade de salvar o status de ligar/desligar em patches e colocar o loop antes ou depois dos modelos de amplificador na cadeia de sinal.